大数据分析让帕金森综合症研究重见曙光

日期:2014-8-19作者:Archana Venkatraman翻译:孙瑞来源:TechTarget中国 英文

【TechTarget中国原创】

近日有媒体曝出,著名影星罗宾·威廉姆斯生前曾患有早期的帕金森综合症,这也许是导致其自杀的原因之一。包括美国前总统里根、我国数学家陈景润以及拳王阿里都是该病的“明星”患者,而目前在全球范围内共有500万人正在经受帕金森综合症的折磨。

作为500万人中的一员,著名男演员Michael J. Fox(曾主演《回到未来》系列电影)自1991年就患上了帕金森综合症。他顽强地与病魔作斗争,并成立了以他名字命名的Michael J. Fox基金会(MJFF),寻求为帕金森综合症患者提供更好的治疗,并对该病进行深入的研究。据 TechTarget记者了解,近期该机构成立了一个新的研究项目,并引入了大数据分析、可穿戴设备以及公有云等IT技术,为找到更好的治疗方案提供支持。

大数据分析让帕金森综合症研究重见曙光

MJFF基金会的负责人Todd Sherer告诉记者,帕金森综合症发现至今已经有200多年了,而我们在跟踪并度量它的时候依然备受挑战,因为每一位患者早期发病的症状都有所不同,而且随着时间的推移也会发生不同的变化。可以说帕金森综合症是多变的,主管的,非连续的。

据了解,MJFF与Intel合作推出了这一研究项目,后者提供了一套开源的大数据分析平台,该平台将运行在AWS上,用来分析从诸多患者收集来的可穿戴式设备数据。

基金会希望通过对上千名患者的运动情况、震颤以及睡眠质量数据的收集,帮助内科医生度量帕金森综合症的发展趋势,并用于新疗法与新药的开发。

“数据科学与可穿戴设备将帮助我们更加客观地衡量患者的实际情况,它对医药开发、诊断以及治疗都非常有帮助。”Sherer说。

可穿戴设备

作为研究的一部分,智能手表能够以实时的速度来收集并传输数据到后台。这些数据可以让研究人员每分钟都能看到患者的情况,每秒钟做上百条记录的分析,从上千名患者中获得大量数据并从中分析模式,获得洞察。

对此Intel数据中心部门高级副总裁Diane Bryant表示,帕金森综合症的多变性使得过去的研究充满了挑战,而新技术的出现则能够为治疗创造一个新的范式,比如可穿戴设备。

MJFF和Intel在今年早些时候一同启动了第一阶段的研究,主要评估了智能手表在跟踪生理信息方面的易用性和准确性,同时使用大数据分析平台来收集并分析这些数据。

其中一位来自美国纽约的46岁患者Bret Parker告诉记者,很多医生会告诉他们的病人自己来记录每天的信息。“在这方面,我不是一个听话的病人,”他说:“可穿戴式设备能够帮我完成这项任务,我不用再去担心其他的事情,这项研究让我在患病过程中变被动为主动。”

接下来,来自Intel的数据科学家们将进行数据关联性的分析,与临床数据以及患者日志来进行对比,从而衡量可穿戴设备的准确性。他们还会为症状以及病程进展度量来开发新的分析算法。

大数据分析与医疗

根据Bryant的说法,医疗数据每年以35%的速度增长,而充分利用并对其进行挖掘就变得异常重要。

“医疗数据比较复杂,在这一领域进行大数据分析需要将三类人更紧密的协作,即数据科学家、医药研究人员和IT技术专家。我们的目标就是提供一个性价比最高的技术,来分析大量数据并通过云环境来分享这些数据。”她说。

Intel的大数据战略就是通过成本效益更好、部署更简单的分析系统,来将大数据更加大众化。大数据分析虽然在过去几年中成为了最流行的IT话题,随着计算与存储设备价格的降低,在企业级层面我们已经看到了大量的应用。Bryant表示,大数据分析在医疗行业的潜力是非常巨大的,通过与MJFF这样的机构合作,Intel将拓展一套解决方案蓝图,并计划将它应用到其他疾病的研究当中。

据了解,该平台整合了一系列的软件组件,包括Cloudera Hadoop(CDH),用来收集,存储并管理数据。Intel还为这家大数据创业公司投资了7.4亿美元。

Intel大数据分析平台每天将从每一位患者身上收集1GB以上的数据。Bryant说:“我们从将近10000名参与者那里收集数据,而且数据将进行加密并安全地存储在位于特拉维夫的数据中心当中。”

云基础架构

据Bryant介绍,Intel的这套平台完全部署在AWS云架构上,使得科研人员能够将精力放在疾病研究上,而无需担心底层的技术架构。AWS提供了强大的、低成本的方式来支持大数据分析,它以用户的数量进行收费。AWS提供了包括数据传输、流数据实时处理等多项服务。

Intel还开发了一套分析应用,用来处理并检测数据的实时变化。通过检测传感器的异常变化,平台能够为研究人员提供一套客观度量病程进展的方法。整个平台是基于开源技术搭建的,它也将保持开放并为全球的医疗研究人员提供服务。

据Bryant介绍,该Hadoop平台未来还计划添加其他类型的数据,包括基因数据、医疗研究数据以及临床试验数据等。它还能够提供其他的高级技术,比如机器学习、图形分析等,能够为科研人员提供更加准确的预测模型,用来检测疾病症状的变化检测。这些都能够为帕金森综合症的研究做出巨大贡献,帮助内科医生更快速地确诊,甚至采取有效地预防措施。

据了解,今年下半年Intel和MJFF还将发布一套移动应用,患者可以通过手机或平板电脑来上传药物服用情况,以及服用后的反应。这也是项目第二阶段要做的,能让研究人员更及时地了解到每一位患者对特定药物的反应,并通过可穿戴式设备进行进一步的观察。

Intel与MJFF项目的合作事实上还有一层意义,他们的前CEO Andy Grove就被诊断患有帕金森综合症,而他也是MJFF基金会的高级顾问。

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Archana Venkatraman is Site Editor for SearchVirtualDataCentre.co.uk. Prior to joining TechTarget Inc., she has worked as a reporter on Information World Review. Archana has over four years of reporting experience on a range of IT and marketing publications in the UK and in India. She holds a BA in English literature and a Masters degree in journalism from Mumbai University. As the site editor, Archana is responsible for all the content on the site. She works with expert contributors in the U

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